期刊简介
本刊登载内容为人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体和病毒基础理论研究和应用研究的新成就，新进展。读者对象为病毒学、微生物学、免疫学等领域的科研和教学工作者以及病毒学的医务工作者。是自然科学的核心期刊。在国外是MEDLINE、MEDLARS数据库，《化学文摘》CA，《生物学文摘》BA等的来源刊，在国内是《中国学术期刊文摘》、《中国医学文摘》、《中国生物医学文摘》等的来源刊。已经加入中国期刊网、万方数据“数字化期刊群”等网络。主要栏目有论著、简报、综述、述评、信息。
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首页>病毒学报杂志
- 杂志名称：病毒学报杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国微生物学会
- 国际刊号：1000-8721
- 国内刊号：11-1865/R
- 出版周期：
期刊荣誉：中国科技核心期刊期刊收录：
A型流感病毒同义密码子的使用偏性对RNA二级结构的影响
李瑞芳；于志芬；黄俏；郭春阳；李雪
关键词：A型流感病毒, 同义密码子使用偏性, RNA二级结构, RNA柔性, 折叠自由能
摘要：以A型流感病毒为研究样本,分析了同义密码子使用偏性对RNA二级结构的影响,为进一步研究同义密码子存在的意义及A型流感病毒RNA特征提供一些理论依据.收集整理了NCBI中收录的全部A型流感病毒的核酸序列信息,计算了每一条核酸序列的RNA二级结构,计算出RNA环结构含量和茎结构含量及折叠自由能.在此基础上,计算了RNA二级结构的柔性.同时,计算了每一条核酸序列的相对同义密码子使用值.由此,建立了A型流感病毒RNA二级结构数据库.分析每条核酸序列的相对同义密码子使用值与RNA的环结构、茎结构及柔性之间的关系.分析结果表明,50％的氨基酸的相对同义密码子使用值与RNA茎结构含量和环结构含量显著相关;60％的氨基酸的相对同义密码子使用值与单位平均折叠自由能显著相关;50％的氨基酸的相对同义密码子使用值与RNA柔性显著相关.进一步分析发现,与茎结构含量和环结构含量都显著相关的密码子,它们的相对同义密码子使用值与两种结构含量的相关性截然相反,而且发现,在所选的参量中,RNA柔性与相对同义密码子使用值显示出更好的相关性.结果证实,对于A型流感病毒,同义密码子的使用偏性对RNA二级结构存在很大的影响.
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