期刊简介

本刊登载内容为人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体和病毒基础理论研究和应用研究的新成就,新进展。读者对象为病毒学、微生物学、免疫学等领域的科研和教学工作者以及病毒学的医务工作者。是自然科学的核心期刊。在国外是MEDLINE、MEDLARS数据库,《化学文摘》CA,《生物学文摘》BA等的来源刊,在国内是《中国学术期刊文摘》、《中国医学文摘》、《中国生物医学文摘》等的来源刊。已经加入中国期刊网、万方数据“数字化期刊群”等网络。主要栏目有论著、简报、综述、述评、信息。

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  • 杂志名称:病毒学报杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 国际刊号:1000-8721
  • 国内刊号:11-1865/R
  • 出版周期:
期刊荣誉:中国科技核心期刊期刊收录:
病毒学报杂志2014年第05期

北京脓毒症患儿血清中发现的3型人副肠孤病毒的全基因组序列分析

朱汝南;罗雷;钱渊;赵林清;邓洁;王芳;孙宇;宋秦伟;丁雅馨

关键词:3型人副肠孤病毒, 全基因组, 系统进化树及同源性分析
摘要:3型人副肠孤病毒(Human parechovirus 3,HPeV3)是2004年发现的与儿童脓毒症密切相关的一种病原体.HPeV基因组是不分节段的单股正链线性RNA.测定其全基因组序列有助于了解北京儿科患者中流行的HPeV3的遗传背景和进化地位.方法采用将一名脑脊液和血清中HPeV3核酸检测均为阳性的脓毒症患儿(编号:BJ-C3174)的血清标本接种到细胞后从培养上清中检测到HPeV3核酸,随后分段扩增HPeV3 BJ-C3174株的全基因组序列,并进行序列测定、拼接及分析.结果表明BJ-C3174株基因组全长(未包括3'末端的PolyA尾)7 329个核苷酸(nt),其中5 '和3'编码区(UTR)分别长707 nt和91 nt,编码区长6 531 nt,可编码一个长为2 177个氨基酸的多聚蛋白.BJ-C3174病毒株与已发表的HPeV3型病毒株位于同一进化分枝,而与HPeV8、HPeV6和HPeV1等型别进化距离较远.BJ-C3174株与德国HPeV3 BONN-2株亲缘关系为密切,两者核苷酸相似性达到99.3%,氨基酸相似性达到99.8%,均高于其与HPeV3原型株A308/99的相似性(89.6%和98.6%).各基因片段中,BJ-C3174株均与BONN-2株相似性高,核苷酸和氨基酸相似性分别达到98.3%和99.3%以上.未发现BJ-C3174株存在基因重组现象.