期刊简介
本刊登载内容为人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体和病毒基础理论研究和应用研究的新成就，新进展。读者对象为病毒学、微生物学、免疫学等领域的科研和教学工作者以及病毒学的医务工作者。是自然科学的核心期刊。在国外是MEDLINE、MEDLARS数据库，《化学文摘》CA，《生物学文摘》BA等的来源刊，在国内是《中国学术期刊文摘》、《中国医学文摘》、《中国生物医学文摘》等的来源刊。已经加入中国期刊网、万方数据“数字化期刊群”等网络。主要栏目有论著、简报、综述、述评、信息。
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首页>病毒学报杂志
- 杂志名称：病毒学报杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国微生物学会
- 国际刊号：1000-8721
- 国内刊号：11-1865/R
- 出版周期：
期刊荣誉：中国科技核心期刊期刊收录：
霍乱弧菌噬菌体VP2基因组序列的测定与分析
王多春；汪敏；李燕萍；董辉；刘中华；刘延清；祁国明；高守一；金维荣；阚飙
关键词：霍乱弧菌, 噬菌体, 鸟枪法, 基因组
摘要：测定并分析了霍乱弧菌噬菌体VP2基因组序列,为VP2生物学特性和功能研究提供分子遗传学基础.为此构建了VP2DNA随机文库,鸟枪法(shot-gun)测定其全基因组序列.测序结果用软件Phrad-Prap拼接成小重叠群(contig),引物步移法测定contigs间的缝隙(gap)序列,拼接后获得VP2全基因组序列.利用生物信息学技术分析VP2基因组,后对VP2和相关噬菌体做DNA聚合酶(DNA pol)基因的进化树分析.结果:VP2属短尾噬菌体科,基因组全长39 853bp,为环状双链DNA,G+C含量为50.56%,较高于霍乱弧菌测序菌株N16961基因组G+C含量;VP2的基因组有碱基使用偏性;预测和注释了45个开放读码框(ORF),分析了DNA复制基因、衣壳蛋白和DNA包装基因、侵染相关基因.DNA pol进化树比较结果,VP2与链球菌噬菌体Cp-1和芽孢杆菌噬菌体GA-1分为一群.根据对VP2基因组序列的测定和分析预测了VP2的ORF,并分析了其中的功能基因,推测VP2在进化关系上属于噬菌体phi29样噬菌体.
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